Заявить НДС-вычет по приобретенным товарам в том налоговом периоде, когда они были приняты на учет, можно, даже если соответствующий счет-фактура получен в следующем квартале.
Это возможно в ситуации, когда нужный счет-фактура был получен до установленного срока сдачи НДС-декларации за квартал, в котором товары были приняты на учет.
Например, если купленные товары были приняты к учету в III квартале, а счет-фактура от продавца пришел в октябре, но до 25 числа (в 2020 году - до 26 числа, так как в этом году установленный срок сдачи декларации за III квартал (25.10.2020) приходится на выходной), никто не запрещает заявить вычет на основании задержавшегося документа уже в III квартале.
Источник: Письмо Минфина